Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms