Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms