Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2aQ6P4T0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms