Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms