Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil1Q6EDY6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil1Q6EDY6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil1Q6EDY6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil1Q6EDY6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms