Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms