Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2cQ69ZS6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms