Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9aQ68FE2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms