Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Stx3Q64704 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Stx3Q64704 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms