Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptpn13Q64512 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptpn13Q64512 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn13Q64512 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn13Q64512 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn13Q64512 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ptpn13Q64512 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn13Q64512 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms