Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt12Q64291 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms