Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ScxQ64124 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms