Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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