Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vil1Q62468 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms