Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms