Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spa17Q62252 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms