Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six2Q62232 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six2Q62232 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms