Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ssr4Q62186 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssr4Q62186 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssr4Q62186 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms