Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4aQ62178 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms