Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprrQ62132 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprrQ62132 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms