Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga7Q61738 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms