Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EsrrbQ61539 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms