Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Msi1Q61474 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Msi1Q61474 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms