Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms