Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pde3bQ61409 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde3bQ61409 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms