Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms