Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms