Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms