Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SkiQ60698 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms