Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms