Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms