Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sin3aQ60520 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sin3aQ60520 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms