Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms