Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh2Q5SW75 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh2Q5SW75 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms