Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynrgQ5SV85 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms