Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd40Q5SUE8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms