Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms