Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms