Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grhl3Q5FWH3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grhl3Q5FWH3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms