Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ecm2Q5FW85 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms