Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkaa1Q5EG47 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms