Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q5EBG8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q5EBG8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q5EBG8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q5EBG8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q5EBG8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q5EBG8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q5EBG8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Q5EBG8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms