Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Fam208bQ5DTT3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam208bQ5DTT3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Fam208bQ5DTT3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Fam208bQ5DTT3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Fam208bQ5DTT3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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