Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
L1td1Q587J6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms