Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Znf608Q56A10 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Znf608Q56A10 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf608Q56A10 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms