Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms