Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms