Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Syne3Q4FZC9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Syne3Q4FZC9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Syne3Q4FZC9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Syne3Q4FZC9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Syne3Q4FZC9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Syne3Q4FZC9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Syne3Q4FZC9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms