Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms