Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Afg1lQ3V384 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Afg1lQ3V384 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms